O tratamento da infecção urinária abrange desde medidas gerais (alta ingestão de líquidos, cuidados de higiene) até a escolha precisa de antibióticos, geralmente baseada na urocultura. Sulfametoxazol-Trimetroprim, nitrofurantoína, quinolonas e cefalosporinas são exemplos de drogas freqüentemente usadas na infecção urinária.
A gravidade dos sintomas também influi na escolha da medicação, sendo que em alguns casos, há necessidade de internação hospitalar para melhor controle do paciente.